在序列分析中常用的一種數(shù)學模型。
在RNA鏈中自身反轉(zhuǎn)允許形成分子內(nèi)堿基配對的位置。
對給定序列從頭到尾進行比較,使盡可能多的字符在同一列中匹配的方法。適用于相似度較高且長度相近的序列。