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【簡(jiǎn)答題】簡(jiǎn)述鄰接法(NJ)構(gòu)樹的算法思想。
答案:
鄰接法的思想不僅僅計(jì)算最小兩兩比對(duì)距離,還對(duì)整個(gè)樹的長(zhǎng)度進(jìn)行最小化,從而對(duì)樹的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)進(jìn)行限制。這種算法由一棵星狀樹開始...
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【簡(jiǎn)答題】簡(jiǎn)述除權(quán)配對(duì)法(UPGMA)的算法思想。
答案:
通過兩兩比對(duì)聚類的方法進(jìn)行,在開始時(shí),每個(gè)序列分為一類,分別作為一個(gè)樹枝的生長(zhǎng)點(diǎn),然后將最近的兩序列合并,從而定義出一個(gè)...
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【簡(jiǎn)答題】簡(jiǎn)述構(gòu)建進(jìn)化樹的步驟,每一步列舉1-2種使用的軟件或統(tǒng)計(jì)學(xué)方法。
答案:
(1)多序列比對(duì):ClustalW
(2)校對(duì)比對(duì)結(jié)果:BIOEDIT
(3)建樹:MEGA ...
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